（一）病因
先天性尿道憩室的成因仍然笼罩在迷雾之中，但科学研究表明，这可能是由以下四个方面的因素导致的。
考虑尿道海绵体先天性发育不良。在这种情况下，尿道腹部组织相对薄弱，面对尿流的压力，前壁容易膨胀凸起，从而形成憩室。
另一种可能的成因是尿道沟不融合。如果尿道壁部分缺损，如尿道下裂，但周围的组织却发育良好，这也能导致憩室的形成。
胚胎时期尿道旁残留的细胞团也可能发展成囊状，并与尿道相连通，进而形成憩室。
还有一种情况，那就是尿道狭窄。特别是在憩室的远端，如Campbell憩室的远端，如果存在尿道狭窄并伴有重复尿道，那么副尿道可能会逐渐扩张，最终形成憩室。Shintaku在1996年报道了一个例子，即Cowper先天性前尿道憩室是由腺管扩张引起的。
对于后天性尿道憩室，也被称为继发性尿道憩室或假性憩室，其主要原因包括：首先是尿道创伤，这是最常见的原因之一。当尿道受到损伤后，周围的血肿、尿外渗以及感染如果得到及时充分的引流，周围的组织可能会机化，并形成憩室壁。尿道结石、尿道周围脓肿等也可能导致憩室的形成。这些脓肿有时会穿透尿道，形成憩室。病原体通常为革兰阴性杆菌混合感染，在某些地区，如埃及，血吸虫病也被认为是原因之一。憩室多位于前列腺，常常是由前列腺脓肿引起的，这在临床上较为常见。
（二）发病机制
先天性尿道憩室的壁面覆盖着上皮细胞，而憩室壁则覆盖着平滑肌纤维。而后天性憩室的壁则主要由机化纤维组织构成。先天性尿道憩室多发生在阴茎和球尿道，位置主要在尿道的腹侧。而后天性尿道则可能在任何部位发生。睡室（应为“憩室”）口的大小不一，先天性憩室口往往较宽，而后天性憩室口则一般较小。在憩室口的边缘远端，有时存在瓣膜。这种瓣膜的成因，有些学者认为是因尿道连接不良所致，也有可能是在排尿时，尿液进入憩室，由于憩室内的压力，将憩室前唇压入尿道而形成。这种瓣膜可能影响憩室的排水。憩室可能继发感染和结石，一旦破裂，甚至可能形成尿瘘。
